Lee un archivo ABIF de un secuenciador Applied Biosystems y devuelve las
bases llamadas, su calidad, la posicion de cada pico y las cuatro trazas.
Esta escrito en R base, sin dependencias de Bioconductor.
Usage
iei_leer_ab1(archivo)
# S3 method for class 'iei_ab1'
print(x, ...)
Arguments
- archivo
Ruta al archivo .ab1 o .abi.
- x
Un objeto iei_ab1.
- ...
No se usa.
Value
Una lista de clase iei_ab1 con bases (texto), calidad
(Phred por base, NA si el archivo no la trae), picos (posicion de
cada base en la traza), trazas (tibble con las columnas A, C, G,
T), muestra y archivo.
Examples
if (FALSE) { # \dontrun{
ab1 <- iei_leer_ab1("BTK_exon15_F.ab1")
ab1$bases
} # }
