Phenopacket de un caso

Arma un Phenopacket de GA4GH (esquema 2.0) como lista de R: el sujeto, el fenotipo usado en la priorizacion (con los signos ausentes marcados como excluded) y las variantes de prioridad alta y media como interpretaciones genomicas candidatas, con su clase ACMG sugerida. El diagnostico propuesto es la enfermedad del gen de la primera variante que mas se parece al fenotipo. Se guarda como JSON con iei_exportar().

Usage

iei_phenopacket(x, muestra = NULL)

Arguments

x

Resultado de iei_priorizar().

muestra

Muestra a exportar; obligatoria si hay mas de una.

Value

Una lista con la estructura del Phenopacket.

Examples

if (FALSE) { # \dontrun{
pp <- iei_phenopacket(prior, muestra = "P01")
} # }