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Todos los terminos vigentes de la Human Phenotype Ontology con su jerarquia, para la similitud semantica de iei_priorizar() y iei_buscar_fenotipo() y la busqueda por texto de iei_buscar_hpo().

Usage

hpo_terminos

Format

Un tibble con una fila por termino:

id

Codigo HPO.

nombre

Nombre en ingles.

padres

Lista con los codigos de sus padres (relacion is_a).

sinonimos

Lista con sus sinonimos exactos.

alternos

Lista con codigos antiguos que hoy apuntan a este termino.

ic

Contenido de informacion: menos logaritmo de la fraccion de genes anotados con el termino o uno mas especifico. Mas alto es mas especifico.

Source

Archivos hp.obo y genes_to_phenotype.txt del release indicado en iei_fuentes(), https://github.com/obophenotype/human-phenotype-ontology.