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Cariograma del panel

Source: R/cariograma.R
iei_cariograma.Rd

Dibuja los 24 cromosomas uno al lado del otro con los genes del panel marcados a la izquierda en el color de su categoria IUIS. Con un resultado de iei_priorizar() marca las variantes a la derecha, del color de su prioridad, y con una busqueda de iei_buscar_fenotipo() marca los genes candidatos, del color de su herencia. Los mejores se rotulan.

Usage

iei_cariograma(
  x = NULL,
  build = c("GRCh38", "GRCh37"),
  etiquetas = 12,
  titulo = NULL
)

Arguments

x

NULL, un resultado de iei_priorizar() o una busqueda de iei_buscar_fenotipo().

build

Version del genoma.

etiquetas

Cuantos genes rotular.

titulo

Titulo del grafico; NULL usa uno por defecto.

Value

Un objeto ggplot.

See also

iei_circos()

Examples

if (requireNamespace("ggplot2", quietly = TRUE)) {
  iei_cariograma()
  iei_cariograma(iei_buscar_fenotipo("candidiasis mucocutanea cronica", n = 10))
}
#> ℹ Fenotipo interpretado como:
#> • candidiasis mucocutanea cronica → HP:0002728 Recurrent mucocutaneous
#>   candidiasis