Graficos de un resultado de iei_sanger — plot.iei

plot() sobre la salida de iei_sanger() dibuja el cromatograma de la variante (iei_cromatograma()) o el dot plot de la lectura frente a la referencia (iei_dotplot()).

Usage

# S3 method for class 'iei_sanger'
plot(x, tipo = c("cromatograma", "dotplot"), ...)

Arguments

x: Resultado de iei_sanger().
tipo: "cromatograma" o "dotplot".
...: Otros argumentos para iei_cromatograma() o iei_dotplot().

Value

Un grafico de ggplot2.

Examples

ab1 <- iei_ejemplo_sanger()
#> Cromatogramas de ejemplo en /tmp/RtmpEJUhwz/sanger_19cf1b19e77b.
ref <- system.file("extdata", "btk_referencia.fa", package = "ieiprio")
v <- iei_sanger(ab1, gen = "BTK", sexo = "M", referencia = ref)
#> BTK_c1632-2_F.ab1: hebra +, 461 bases alineadas en X:101353757-101354217,
#> identidad 99.8%.
#> BTK_c1632-2_R.ab1: hebra -, 461 bases alineadas en X:101353758-101354218,
#> identidad 99.8%.
plot(v, tipo = "dotplot")